文档包含正文，附件：研究方案及技术路线、人员配置及分工、设备清单及技术参数、项目里程碑及付款节点、保密协议、项目风险评估及应对措施、数据管理计划、项目交付清单、保密级别和处理规范、项目成果转化计划。
基因组学研究合同
甲方（委托方）：____
乙方（受托方）：____
鉴于甲方需要进行基因组学相关研究，经双方友好协商，就相关事宜达成如下协议：
第一条 研究内容和目标
1.1 研究项目名称：____
1.2 研究内容：
1.2.1 全基因组测序：使用Illumina NovaSeq 6000测序平台，进行30X深度的全基因组测序。
1.2.2 基因组组装：使用SPAdes v3.15.3软件进行从头组装，N50值不低于1Mb。
1.2.3 基因组注释：使用MAKER v3.01.03进行结构注释，Augustus v3.3.3进行基因预测。
1.2.4 基因组编辑：使用CRISPR-Cas9系统，针对目标基因进行精确编辑，编辑效率不低于80%。
1.2.5 遗传多样性分析：使用STRUCTURE v2.3.4软件进行群体遗传结构分析，计算FST、π值等遗传多样性指标。
1.3 研究目标：
1.3.1 完成不少于100个样本的全基因组测序和分析。
1.3.2 鉴定不少于10,000个单核苷酸多态性（SNP）位点。
1.3.3 完成至少3个关键基因的功能验证。
1.3.4 提交不少于2篇SCI论文，其中至少1篇IF>5。
第二条 研究周期
2.1 本项目总周期为18个月，自__年__月__日起至__年__月__日止。
2.2 研究进度安排：
2.2.1 第1-3个月：样本收集和DNA提取
2.2.2 第4-6个月：全基因组测序和数据质控
2.2.3 第7-9个月：基因组组装和注释
2.2.4 第10-12个月：基因组编辑实验
2.2.5 第13-15个月：遗传多样性分析
2.2.6 第16-18个月：数据整理和论文撰写
2.3 乙方应当在每个季度结束后5个工作日内向甲方提交书面进度报告。
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